python + selenium 自动化测试脚本
有输入也要有输出系列1
需求：RNA minimum free energy预测，RNAfold WebServer 在线版，虽然RNAfold有本地版，但是本地版和在线版的结果不一样，而我的数据结果和在线版一致，所以需要使用在线版来预测。
){kind=link}
优点：
- 在线版结果是我所需要的。
- 在线版的mfe之外的其他结果辅助
缺点：
- 在线版一次只能跑一条序列
所以希望能用脚本，一次性能提交多条序列，循环跑。
如图所示，需要在第一个文本框中填写RNA sequence,其他各个参数为默认参数，提交Proceed。运行结果如下，我需要得到下面四个数据。
准备工作：
-
Python 3.6.1 Anaconda 4.4.0 (64-bit) - Firefox
- 下载geckodriver.exe安装在Firefox的文件夹下
from selenium import webdriver
import time
def automate(sgRNA):
dr = webdriver.Firefox(executable_path = 'F:/software/firefox/geckodriver.exe')
url = 'http://rna.tbi.univie.ac.at/cgi-bin/RNAWebSuite/RNAfold.cgi'
dr.get(url)
#文本框的id为SCREEN
dr.find_element_by_id("SCREEN").send_keys(sgRNA)
#submit为class name 为proceed
dr.find_element_by_class_name('proceed').submit()
#如果下面几个find element 出现out of range，有可能是页面还没有缓冲出来，所以要足够的sleep的时间
#这里设定的30s是可以work的，当然也是在网速好的时候
time.sleep(30)
#下面三个均为提取element的code，感谢志恒师兄的帮助，我自己一点也不懂html
main = dr.find_element_by_id('contentmain')
ps = main.find_elements_by_tag_name('p')
p = ps[2].find_elements_by_tag_name('b')
#minimum_free_energy
mfe = ps[0].find_element_by_tag_name('b').text
#free_energy_of_the_thermodynamic_ensemble = p[0].text
frequency_MFE_structure = p[1].text
ensemble_diversity = p[2].text
return mfe,frequency_MFE_structure,ensemble_diversity
time.sleep(3)
dr.close()
写个for 循环就可以调用这个function，这样就可以批量跑RNAfold了。